Основной причиной загрязнения Колымы названа деятельность золотодобытчиков Магаданской области.
Список самых грязных рек России подготовил журнал «Огонёк» на основе ежегодного доклада Минприроды «О состоянии и об охране окружающей среды РФ».
В воде Колымы, по данным Минприроды, содержатся высокие концентрации железа, меди, марганца, а также фенол с нефтепродуктами, свинец и аммонийный азот. Загрязнителями специалисты назвали золотодобывающие предприятия Магаданской области, использующими 44% воды региона на разработке драгоценных металлов. Объём сброса «недостаточно очищенных» сточных вод оценивается в 14 миллионов кубометров.
Среди других загрязнённых рек Минприроды называет Обь, Волгу, Амур, Днепр, Енисей.